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      測序芯片/cexuxinpian
      外泌體全轉錄組測序
      發布時間: 2018-09-27 14:23:18 | 次瀏覽

              外泌體(Exosome)是活細胞分泌的直徑約為30-150nm的膜性囊泡,囊泡內包含有豐富的miRNA、lncRNA、circRNA。其中,miRNA是生命活動中重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝紊亂發揮著重要的作用。基于Illumina高通量測序平臺的small RNA測序技術不受物種限制,具有高靈敏度和高精確性,既能鑒定特定條件下表達的miRNA,也能發現新的miRNA。同時還可用生物信息學分析篩選在特定條件下差異表達的miRNA。
              lncRNA是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA。研究表明, lncRNA 在劑量補償效應(Dosage compensationeffect)、表觀遺傳調控、細胞周期調控和細胞分化調控等眾多生命活動中發揮重要作用,成為遺傳學研究熱點。
              環狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子,也是RNA領域最新的研究熱點。與傳統的線性RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈封閉環狀結構,不受RNA外切酶影響,表達更穩定,不易降解。在功能上,近年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結合位點,在細胞中起到miRNA海綿( miRNA sponge)的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達水平;這一作用機制被稱為競爭性內源RNA(ceRNA)機制。通過與疾病關聯的miRNA相互作用, circRNA在疾病中發揮著重要的調控作用。
              因為Exosome里包含有豐富的miRNA、lncRNA、circRNA,所以近年來外泌體逐漸成為科學研究的熱點領域。上海海方生物擁有強大的技術團隊,為您提供外泌體RNA全轉錄組(包含mRNA、lncRNA、circRNA)測序技術服務。
       
       
       
       
      技術優勢
      1、豐富的外泌體分離抽提經驗,采用進口試劑盒,能夠從多種樣本中獲得高質量的外泌體。
      2、豐富的外泌體總RNA抽提經驗,能夠從少量樣本中獲得高質量的外泌體總RNA。
      3、豐富的建庫經驗,根據外泌體RNA質量,采用合適的RNA建庫方法,滿足不同的研究需求。
      4、極高的覆蓋度,通過采用優化過得新一代高通量測序技術,可以檢測到低豐度的稀有circRNA。
      5、專業的生物信息分析團隊,提供專業的數據分析及可直接用于文章發表的圖表。
       
       
       
       
      數據分析內容:
      1、基礎數據分析
      ①原始數據質控檢查;
      ②比對結果質控檢查;
      ③基于基因表達的樣品主成分分析;
      ④差異基因表達及相關通路富集分析;
      ⑤環狀RNA預測及鑒定;
      ⑥環狀RNA差異分析;
      ⑦差異環狀RNA宿主基因的通路富集分析;
      ⑧差異環狀RNA的靶向miRNA預測分析;
      ⑨lncRNA差異分析;
      2、高級數據分析
      ①基于基因表達的通路活性分析;
      ②轉錄調控活性分析及通路互作分析;
      ③差異長鏈非編碼RNA的調控基因的通路富集分析;
      ④環狀RNA及靶向miRNA網絡調控制圖
       
       
       
       
      樣品要求:
      血清樣本: 5ml  (全血10ml);
      血漿樣本: 5ml  (全血 8-10ml);
      無血清培養細胞上清:50ml;
      其他如尿液、卵泡液、精液、分離好的外泌體、提好的總RNA等的樣本要求請詳詢工作人員。
       
       
       
       
      運輸條件:
      客戶郵寄標本需使用干冰運輸,請提前跟公司銷售聯系并告知快遞單號;也可聯系公司銷售員上門取樣。
       
       
       
       
      測序周期:收到樣品后6周左右反饋結果。

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